De acordo com o Portal do Empreendedor, são obrigações de um MEI:
Pagar uma contribuição mensal (DAS);
Emitir NF quando realizar negócios com pessoas jurídicas (para negócios realizados com PF, a emissão de NF é opcional, com algumas exceções);
Preencher um Relatório Mensal (que pode ser acessado através desse link aqui);
Guardar notas fiscais de compra e venda por 5 anos;
Enviar uma Declaração de Faturamento Anual;
Outras obrigações como limite de compra e pagamento de diferença de alíquota.